Modalités, trajectoires préférentielles et facteurs explicatifs des dynamiques de diffusion spatio-temporelle des épidémies de choléra en République Démocratique du Congo (RDC) Modalities, preferential trajectories and explanatory factors of the spat

Le choléra est une maladie diarrhéique aigüe sévère causée par les souches de la bactérie Vibrio cholerae productrices de la toxine cholérique. La charge de morbidité et de mortalité due au choléra est très élevée en Afrique Subsaharienne. La République Démocratique du Congo (RDC) fait partie des pays les plus touchés au niveau africain. À l’échelle du pays, le choléra est endémique dans sa partie Est suite à la présence de zones bordant les lacs du Grand Rift Africain. Ces zones constituent les points d’origine d’épidémies qui diffusent vers d’autres zones avoisinantes et éloignées. Cependant, la compréhension des dynamiques de diffusion épidémique de choléra comporte encore des zones d’ombre à cause de la variabilité de leurs schémas spatio-temporels et de leurs mécanismes explicatifs. Cette recherche doctorale a été conduite pour décrire les modalités de diffusion spatio-temporelle des épidémies de choléra, identifier leurs trajectoires préférentielles et déterminer les facteurs qui les modulent. À l’aide de la revue de la littérature (1973-2018) et l’identification des clusters spatio-temporels de cas suspects de choléra (2000-2018) à l’échelle des zones de santé par le biais de la statistique de scan spatio-temporel rétrospectif de Kulldorf, quatre modalités de diffusion épidémique de choléra à partir des foyers endémiques lacustres de l’Est ont été décrites en fonction de grands espaces géographiques touchées ou traversées : les provinces endémiques de l'Est et les autres provinces non endémiques de l'Est, du Centre et de l'Ouest. Les trajectoires préférentielles des épidémies ont été déduites à partir de la directionnalité des clusters spatio-temporels de cas. Pour les épidémies majeures ayant atteint la partie Ouest de la RDC, des schémas de diffusion spatio-temporelle supplémentaires ont été identifiés le long du fleuve Congo, allant des foyers épidémiques du Sud-Ouest vers le Nord. En outre, les divers modèles appliqués dans cette étude ont permis de suggérer que le risque de propagation épidémique majeure de choléra en dehors des provinces endémiques, notamment le Nord et le Sud-Kivu, est potentialisé par l’exacerbation des conflits, suivie de l’intensification des mouvements de personnes déplacées internes et de l’amplification des flambées épidémiques de choléra autour du bassin du lac Kivu. Cette étude a permis de montrer que les dynamiques de diffusion épidémique de choléra sont prévisibles. La prise en compte de leur caractère prédictif dans l’élaboration et l’implémentation des stratégies ciblées de lutte contribuera à atteindre les objectifs d’élimination de cette maladie. Cholera is a severe acute diarrheal disease caused by cholera toxin-producing strains of the bacterium Vibrio cholerae. The burden of disease and death due to cholera is very high in sub-Saharan Africa. The Democratic Republic of the Congo (DRC) is one of the most affected African countries. Cholera is endemic in the eastern part of the country due to the presence of areas bordering the Great Lakes of the African Rift. These areas are the points of origin of epidemics that spread to other neighboring and distant areas. However, the understanding of the dynamics of cholera epidemic spreading remains unclear due to the variability of their spatio-temporal patterns and their explanatory mechanisms. This doctoral research was conducted to describe the spatio-temporal diffusion patterns of cholera epidemics, identify their preferential trajectories and determine the factors that modulate them. Based on the literature review (1973-2018) and the identification of spatio-temporal clusters of suspected cholera cases (2000-2018) at the health zone level using the Kulldorf retrospective space-time scan statistics, four modalities of spread of cholera epidemics from the endemic eastern lake areas were described according to the main geographical areas affected or crossed: Eastern endemic provinces and other non-endemic provinces in the East, Center, and West. Preferential epidemic routes were inferred from the directionality of the spatio-temporal clusters of cases. For the major epidemics that reached the western part of the DRC, other spatio-temporal diffusion patterns were identified along the Congo River, moving from southwestern to northern epidemic foci. Furthermore, the different models applied in this study suggest that the risk of a major cholera epidemic spreading outside the endemic provinces, notably North and South Kivu, is potentiated by the exacerbation of conflicts, followed by the intensification of movements of internally displaced persons and the amplification of cholera outbreaks around the Lake Kivu basin. This study has shown that the dynamics of cholera epidemic diffusion are predictable. Considering their predictive character in the development and implementation of targeted control strategies will contribute to achieve the goals of eliminating this disease.